十四世纪伴随着传统的艺术家画室还有教会组织的画会，如1339年以传授宗教绘画为主的圣路卡画会及梅迪奇家族庇护下的画家团体。1563年，画家和艺术史家瓦萨里在佛罗伦萨大公科希莫一世的支持下，重新组织了佛罗伦萨设计学院，除教授传统的壁画，胶画外，还设有天花板饰，金箔装饰，青铜装饰等手工技巧课。这种绘画与工艺装饰的结合的教学方式奠定了风格主义的基础，由於瓦萨里对风格主义的肯定，从1600年-1700年间风格主义影响到罗马直至卡拉齐的教学体系。
作为公立的美术学院，佛罗伦萨美术学院建于十八世纪和十九世纪之交。1785年，在奥地利国王Pietro Leopardo的倡导下成立。当时的专业有雕塑，绘画，建筑，版画和裸体素描。教学是延用古典主义绘画的教学方法，称之为“写实主义大师聚集的皇家美术学院” ，教学常常是模仿乌菲奇博物馆的名作以锻练学生的写实能力。为了准确的掌握形体写实的技巧，从基础素描，绘画，到最后的分科专功要学习12年。
1860年意大利王国成立以后，托斯卡纳政府的教育部门宣布“艺术教育自由” 的法令。艺术家的私人工作室纷纷出现，这一变化并不意味着艺术教育退回传统 - 在画师具体指导下的创作，而是一个艺术团体的认同。此时，与画室艺术不同的美术学院教育成了“保守” 的代名词。
随着十九世纪末意大利艺术教育在高中的普及，佛罗伦萨美术学院成为高等的艺术教育院校，取缔了初级班，学制四年。二次世界大战后，艺术形式的研究开始为学院所重视，抽象主义不再被认为是游戏的行为了。
现学院有四个专业：绘画，雕塑，装饰和舞台美术。另有版画和裸体素描进修班提供给艺术爱好者。