爱沙尼亚有六所国立大学，还有七所由国家投资的大学和九所已注册的私立专科学院，在1998至1999学年初，有18所私立高校，其中的六所提供学位课程学习。
高等教育
在爱沙尼亚有两种类型的高等学府：一种是大学，主要提供学术方面的高等教育和毕业文凭的课程学习；另一种是应用高等教育学府，提供文凭课程学习。
应用高等教育包括文凭课程（四年制ISCED6）。
学术高等教育（大学），提供学士学位（四年制ISCED6），硕士学位（两年制ISCED7），博士学位(四年制ISCED7)。
研究生教育
若想获得博士学位，进行充足的研究工作是很必要的，这需要额外的2到4年来完成。
入学资格和条件
海外申请人需提供已完成高中学业的证明或在本国已拥有进入大学的资格。不同的学校有可能提供不同的入学条件。
申请的截止日期一般是五月或六月，不同的学校可能有不同的申请截止日期和要求等等。
为了考察申请人的适应能力，一些高等学府会要求面试。
语言要求
在爱沙尼亚的许多学校教学的第一语言是英语，然而在各个不同的学校，德语、俄语、芬兰语或意大利语也可作为教学语言。
海外留学生如果想取得学位在入学前必须通过一个语言考试。
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