1463年正式成为国家，16世纪前长期处于封建割据状态。16世纪初受西班牙统治。1568年爆发延续80年的反抗西班牙统治的战争。1581年北部七省成立荷兰共和国（正式名称为尼德兰联合共和国）。1648年西班牙正式承认荷兰独立。17世纪曾为海上殖民强国，继西班牙之后成为世界上最大的殖民国家。18世纪后，荷兰殖民体系逐渐瓦解。1795年法军入侵。1806年拿破仑之弟任国王，荷兰被封为王国。1810年并入法国。1814年脱离法国，翌年成立荷兰王国（1830年比利时脱离荷兰独立）。1848年成为君主立宪国。一战期间保持中立。二战初期宣布中立。1940年5月被德国军队侵占，王室和政府迁至英国，成立流亡政府。1945年恢复独立，战后放弃中立政策，加入北约和欧共体及后来的欧盟。
在古罗马时代，莱茵河南的地区先是属于“比利时高卢”省，后归于“日耳曼行省”。这里的北部地区居住着许多日耳曼部落，南部则是高卢人，而这些高卢人在移民时期也融合了许多日耳曼部落，其中撒利恩法兰克人从这里迁移到高卢，并在公元五世纪建立起了强大的墨洛温王朝。
中世纪，低地国家（大约包括现在的荷兰、德国西部部分地区、卢森堡、比利时、法国北部部分地区）存在着很多诸侯封建领地，分别属于勃艮地公国和神圣罗马帝国。到了十六世纪初，因为复杂的皇室联姻，他们在神圣罗马帝国哈布斯堡王朝之下统一起来。
1556年帝国皇帝卡尔五世（1519年—1556年在位）退位，将西班牙和低地（被称为北方省）分给他的儿子腓力二世，将奥地利等其他地区以及哈布斯堡王朝正统分给他的弟弟斐迪南一世。就这样，北方省属于西班牙王国。
1568年，因反抗西班牙国王的中央集权和对新教加尔文派的迫害，爆发了北方省反抗西班牙的八十年战争。1579年北方省中的七省（现在荷兰、比利时和卢森堡的区域）成立了乌得勒支联盟，共同反对西班牙统治。这被认为现代荷兰的开始。1581连盟正式宣布独立。战争在继续，直到1648年西班牙国王菲利普四世才签订《明斯特条约》，承认七低地尼德兰七省联合共和国（Republiek der Zeven Verenigde Nedel'landen/Provinciën），从西班牙获得独立之后，荷兰发展成为17世纪航海和贸易强国。荷兰的商船数目超过欧洲所有国家商船数目总和，被誉为“海上马车夫”。荷兰在世界各地建立殖民地和贸易据点。这段时期在荷兰被称为“黄金年代”。
17世纪后期，荷兰先后与英国、法国交战，在海上荷兰败于英国（英荷战争），在陆地荷兰败于法国（法荷战争），从而衰落下来。1795年荷兰被法国占领。
在1815年被拿破仑统治的法国占领结束后，荷兰和现在的比利时、卢森堡组成荷兰王国（Het Verenigd Koninkrijk der Nedel'landen）。比利时很快在1830年独立，卢森堡也紧随其后。19世纪中，荷兰相对于其邻国比较落后。
荷兰在一战中保持中立。荷兰在二战中自1940年5月被德国占领直至1945年才被解放。战后，荷兰经济再度繁荣富强。