日本很早就开始实施光脚教育。主要是在小学、幼儿园、托儿所等按照规定时间让儿童过光脚生活，并以此达到增进孩子体质的目的。发起者是福岛县白河市的白河市立关边小学的校长理崎三郎。他偶然看到孩子们光着脚在水泡中游玩，并感到光脚才是脚所处的最自然状态。于是他开始提倡让孩子们光脚运动。此后经过研究发现，光脚活动可以让脚趾自由灵活，有利于脚心的成长。而且光脚活动还可以让脚拥有自我调温机能，即使炎热的夏季也会感到捂脚。此外还不容易感冒等。如果对脚心给与足够的刺激还能促进脑的活性化等。
现在日本人普遍认为脚就是人的第二个心脏。目前，有的学校要求学生只要上学就光脚，有的学校要求学生只在体育课时光脚，还有的学校只让学生在夏天光脚。为此，实施光脚的学校常常以此为自豪，并成为好学校的一个标准。
福冈市里儿童病院感染中心整形外科医长柳田晴久还认为，给脚心适当的刺激可以起到增强肌肉的强度，孩子们多在沙滩、草地等行走可以防止扁平足的发生。
目前的日本，光脚运动还扩展到成人中。高知地区的黑潮町每年都举行成人光脚马拉松赛跑。
但是，对于光脚教育日本人也有有人持不同看法，有的人认为不卫生，容易感染病菌、危险等。鉴于此，青森支援中心代表八户市的向谷地贵心为了给孩子们提供可以安心光脚行走的土地，把自家农地变成了无农药、无化肥的绿色田地，并向附近的幼儿园孩子们开放。这样由大人和孩子们一起光脚种出来的米被命名为“童心米”，受到好评。